巨细胞病毒对于免疫功能正常的人完全可以治好，对于免疫功能不好的人不一定能治好，可能病情会较重。虽然巨细胞病毒感染可以导致发烧、淋巴结肿大、嗓子疼、肺炎、肝炎，只要免疫功能正常，免疫系统会压制住病毒，阻止病毒继续侵袭人体。这种情况不需要额外治疗、干预，一般不建议用特异性的抗病毒药物。
部分免疫功能较差的感染者，如血液病患者需要做化疗、造血干细胞移植术，巨细胞病毒感染会导致病情加重，损害更多的器官，病变可能难以控制，甚至导致脑炎、视网膜病变、失明、肺炎、肠炎、肝炎等。这种情况下需要积极 应用特异性的抗病毒药，如更昔洛韦，也可进行支持治疗。由于免疫力相对较差，治疗效果通常不佳。