室间隔缺损的并发症包括支气管肺炎、充血性心力衰竭、肺水肿以及感染性心内膜炎，但并非每个室缺患者都会出现并发症，越小的缺损对机体的影响也越小，因此患者可能不出现临床并发症。当室间隔缺损为中、大型时，常由于左右心肺血的异常改变而出现临床并发症，具体如下：
1、肺炎：肺炎好发于婴儿，冬春季多见，表现为发热、咳嗽，肺部存在固定的湿啰音，严重时还会导致呼吸衰竭，X线可观察到患者两肺纹理增浓以及斑片影；
2、充血性心力衰竭：婴儿出现充血性心力衰竭时表现为喂养困难、出汗较多、消瘦、生长发育落后等，体检时会发现患者肝大，同时伴有心跳、呼吸加快；
3、肺水肿：肺水肿为更严重的并发症，除咳嗽、呼吸困难外，还可听到双肺哮鸣音，患者脸色苍白、口唇青紫，并伴有呼吸困难，可闻及两肺细湿啰音；
4、感染性心内膜炎：此类患者常表现为发热、疲倦、体重减轻、贫血、肝脾肿大、栓塞以及特殊皮疹等，常合并心力衰竭。
儿童合并上述并发症时常危及生命，建议尽早前往医院就诊。