右侧卵巢囊性暗区的原因有生理性原因，也有病理性原因，具体如下：
1、生理性原因：可能是因为黄体囊肿所导致的右侧卵巢囊性暗区。正常情况下，黄体在来月经之前会萎缩、消失。但是有的人在来月经的时候还没有萎缩、消失，所以通过B超检查则发现有囊性暗区。一般在月经干净以后，往往会明显缩小或者消失；
2、病理性原因：比如出现巧克力囊肿或者浆液性囊肿、黏液性囊肿，上述囊肿到目前为止病因还不清楚。一般小的囊肿临床可以动态观察，疾保守治疗，比如定期做B超检查。如果出现不规则流血、下腹部疼痛等，建议尽快到医院复诊。而大的囊肿通常需要做手术给予治疗。对于年轻的女性，手术治疗可以把囊肿单纯给予剔除，保留卵巢，使卵巢继续发挥周期性分泌雌孕激素的功效，并且使卵巢还能排卵，也达到了治疗疾病的目的。因此建议女性定期到医院检查，因为小的囊肿可能没有任何症状。每年检查一次，以便发现异常，然后及时给予处理。