不适合高压氧的治疗的主要是气胸患者，在高压氧当中可能会有气压伤，对于气胸，尤其是没有经过干预治疗的气胸，这要绝对警惕。另外有多发性肋骨骨折和骨折患者也要禁忌，传染性疾病如肺结核、肺空洞，尤其是空洞型肺结核，这类患者也要禁忌，使用抗肿瘤药物的患者也要禁忌。
除此之外还有相对的紧急症，比如妊娠三个月的患者尽量少用，处于癫痫或癫痫活动期的患者要尽量避免高压氧的治疗，有时高压氧会产生氧中毒等。对于高压氧舱的选择有相应的适应症，要去咨询高压氧舱方面的专家，看看是否存在这种现象。表明是否在妊娠期三个月内、是否有近期骨 折等，向医生讲明情况后再决定是否适合高压氧治疗。