儿童脑寄生虫感染常见的有脑囊虫病、脑型血吸虫病、脑型肺吸虫病、包虫病及脑型疟疾等。检查包括血常规、粪常规、脑脊液检查、免疫学检查、胸腹部CT、头颅磁共振检查等。脑囊虫感染时，血常规中白细胞总数可以正常，但个别患者会出现白细胞升高、嗜酸性粒细胞增高。
粪便检查发现绦虫卵是诊断囊虫病的依据。脑脊液检查一般表现为压力正常或者升高，脑脊液中白细胞增高，以淋巴细胞增高为主，还可以出现嗜酸性细胞增高。免疫学检查主要是寄生虫抗体检查，也可以作为诊断依据。头颅磁共振能够发现病变部位，确定病变位置、大小以及病变数目，还可以显示出脑水肿、脑积水、脑室形态等。胸腹部CT检查用于寻找体内其它部位的寄生虫感染灶。