直肠癌发生肠瘘的原因有两个，一个就是直肠越到下面血供越差，第二个就是直肠和结肠所受到的压力不一样，受到的压力大，就不容易愈合，受到压力小的就容易愈合。如小肠就很容易愈合，大肠，如结肠，就容易发生吻合口瘘，到低位直肠，吻合口瘘的发生率更高。
直肠癌肠瘘主要眼于预防，吻合口在腹膜反折以下时，建议进行常规的回肠造瘘，使大便从上面获得转流，该处没有大便通过后，吻合口肠瘘的发生率就会降低。否则一旦发生肠瘘，就会导致吻合口狭窄，而狭窄会导致患者功能下降，后期很难用扩张器将其扩张，因此术后肠瘘的处理只有一个办法，即进行预防 。
对于反折以上的肠段，不进行常规的回肠造瘘，而进行吻合。临床认为反折以上吻合口瘘的发生率与直肠癌瘘发生率接近，都为1%-2%左右，不是特别重要。