十二指肠是小肠最上端部分，起始于胃幽门，在骶腰椎右侧呈七字形包绕在胰头部，十二指肠空肠区和空肠相连，总长大约25-30cm。
十二指肠和其他小肠的不同之处在于位置较深，紧贴腹后壁，在1-3腰椎的右前方，位置相对较固定。除起始部位外，其大部分在腹膜后，肠腔较宽，和胰、胆管关系密切。十二指肠在形态上分为球部、降部、水平部和升部，具体如下：
1、球部：起始于幽门，向右并向后上走行，是十二指肠溃疡好发位置，前壁溃疡容易出现穿孔，后壁溃疡可以穿透至网膜囊；
2、降部：主要在腰椎右侧，向下走行，在内侧方可以有胆总管和胰管汇合，流入十二指肠，右侧是胰腺；
3、水平部：起始于降段，它的上方是胰腺，前方有十二指肠、肠系膜上动脉，肠系膜上动脉如果起始位置较低，就可以压迫十二指肠水平部，出现肠系膜上动脉压迫综合征 ；
4、升部：是水平部向左上到十二指肠悬韧带，即屈氏韧带，屈氏韧带是划分上消化道与中消化道的界限。
所以十二指肠的解剖结构和胰、胆管关系较密切，它出现疾病的时候，往往会引起胰、胆管，甚至肝脏相关的病症出现。