多西环素属于四环素族，对于尿路感染治疗并不是主要的治疗药物，仅在一些特殊类型的感染下推荐使用，比如支原体和衣原体导致的感染。
细菌是导致尿路感染最常见的病原微生物，治疗用药选择强有力的抗菌素，抗菌素的使用根据尿培养的结果来进行选择。
下尿路感染推荐使用磷霉素氨丁三醇、匹美西林、呋喃妥因、喹诺酮类以及第二代和第三代头孢菌素，口服即可。女性采用单剂疗法或者3日短程疗法，男性一般需要应用7天。
上尿路感染合并全身症状时，推荐使用静脉应用抗菌素，比如第三代头孢菌素、氨基糖苷类抗菌素、合成青霉素以及第三代喹诺酮类抗菌素，通常用药的周期为两周左右，需要根据病情判断是否继续口服抗菌素。