血尿的颜色有好多种，有的时候镜下血尿都看不出颜色，只是有点偏黄、偏绿。有的时候尿里面红细胞较多，虽然还是镜下血尿，但是此时可能体现出尿色稍深，或者发黄或偏粉。
还有已经明确的肉眼血尿，尿色会变成洗肉水色样，或者是暗红色或鲜红色。有时尿里面会有很陈旧的暗红色，即发棕的颜色，称之为血红蛋白尿。在严格意义上，其跟血尿要区分开。所以在镜下血尿的时候，可以表现为尿色偏正常，或者尿色偏深、偏黄、偏茶色，由尿里面的红细胞量、镜下血尿的严重程度来决定。
红细胞越多，血尿的程度越重，颜色也会越深。等到血量很多，已经是肉眼能看到的红色、鲜红色、暗红色、粉色。这个时候就不叫镜下血尿，就叫肉眼血尿。肉眼血尿也是看出血量的多少、出血时间的长短，则会表现不同的颜色。