儿童癫痫的首选治疗方法为药物治疗，有1/4的患儿不治疗也会好转，这种为良性癫痫。良性癫痫里有一部分患儿随着年龄增大不再发作，但是多数癫痫患者需要药物治疗。
治疗癫痫的药物有多种，有不同的作用机制，需根据发作类型选择合适的药物，并持续用药，至少需要服药3-5年，不可随意停药。如果在服药期间病情稳定、没有发作，则无需调整药物。如果患者在服药过程中有一定发作，还要调整药物，如果使用2-4种药物经过1年都无法控制癫痫，可以在脑内能找到真正病灶时，如海马硬化、占位、皮层发育不良等结构性异常，此时需考虑手术，但多数患者手术后还需要一定的药物治疗。因此，儿童癫痫的治疗方法首选药物，药物治疗难以控制时才会考虑手术、特殊饮食或者其它治疗方法。