药物治疗适用于症状轻，近绝经年龄或全身情况不宜手术者。药物治疗的目标是缓解疼痛或其它症状，纠正月经出血过多引起的贫血。在手术切除肌瘤或子宫之前让肌瘤萎缩，可能会减少手术损伤及术时出血，避免切除子宫。可选择的药物有：
1、促性腺激素释放激素类似物，即GnRHα，采用大剂量连续或长期非脉冲式给药，降低雌激素至绝经后水平，可抑制肌瘤生长，使其萎缩，但停药后又逐渐增大，用药后可引起绝经综合征，长期使用，可引起骨质疏松等副作用，故不推荐长期用药；
2、米非司酮，可作为术前用药或提前绝经使用，但不宜长期使用，因其拮抗孕激素后，子宫内膜长期受雌激素刺激，增加子宫内膜病变的风险；
3、中药如桂枝茯苓胶囊、宫瘤清胶囊等；
4、其它对症药物如贫血时使用铁剂，纠正贫血。