艾灸会阴穴可以治疗泌尿生殖系统疾患，同时艾灸会阴穴还有急救、促醒的作用，昏迷、溺水的患者可以艾灸会阴穴。会阴穴是任脉的穴位，汇于会阴部，因此艾灸会阴穴可以治疗如小便不利、尿频、尿急、癃闭以及前列腺增生导致的夜尿频、急等泌尿系统问题。
不孕不育或女性的月经不调、痛经、崩漏、月经周期的不固定以及男性的阳痿、遗精，艾灸会阴穴同样可以治疗。会阴穴比较隐匿，在艾灸的过程中要注意安全问题，因为看不到穴位，所以要防止烫伤。
除艾灸外也可以用坐浴的方式来刺激会阴穴，同样可以治疗各种泌尿生殖系统问题，同时还有助于改善睡眠。