低级别上皮内瘤变，实际是良性肿瘤的表现。一般以前病人有癌变，称为原位癌，现在称其为高级别上皮内瘤变。高级别上皮内瘤变较低级别上皮内瘤变要更为严重。所以发生低级别上皮内瘤变无需紧张，是一种良性病变，逐渐发展才可变为高级别上皮内瘤变。
治疗也较为简单。因为低级别上皮内瘤变往往较小，不会长得很大，通过内镜下治疗都可以完全切除。少数病人可能切掉后进行病理化验，发现有癌细胞，但层次较深，可再进行外科手术补救，预后非常好，对寿命没有影响。但是该病要求手术后，一定要定期复查。因为低级别内瘤变往往伴随结肠息肉、腺瘤表现，往往容易出现在其它部位，所以一定要在手术一年后进行肠镜复查。