儿童肠胃功能紊乱恢复时间因人而异，如果单纯饮食因素导致的肠胃功能紊乱，可以通过饮食调整，或者适当口服帮助消化的食物、药物等进行辅助性治疗，一般1周内即可恢复。通常饮食因素所致者恢复较快，如果本身存在肠道疾病，尤其是肠道急性疾病，如急性肠炎病毒感染，则不同的病毒性肠炎恢复时间不同。
临床最常见的是轮状病毒肠炎，后续可能出现消化吸收功能紊乱，多数患者在1-2周内可以完全恢复正常。部分儿童体重较轻、营养状态较差，恢复时间可能较长，甚至2-3周左右才能恢复。如果大年龄儿童2-3周内无法恢复正常，需注意是否平时在出现胃肠功能紊乱后，未进行适当的饮食控制，即少量多餐、进食容易消化食物等。因此需进行相关评估，如果饮食方面做得较好，恢复时间长，2-3周未恢复，建议去医院就诊，评估可能的 原因。