智齿发黑主要是以下两点原因，一个是色素沉着，另一个是龋齿，具体如下：
1、色素沉着：因为智齿长的位置靠里，所以刷牙不能很好的刷到，有一部分智齿长得歪，比如上颌智齿容易向颊侧倾斜，下颌智齿容易向近中颊侧倾斜，导致牙刷不容易刷到智齿表面，造成智齿表面容易附着食物中的色素，饮料中的色素，包括抽烟时烟中的色素，都特别容易在牙齿表面沉积，又不能通过刷牙很好的清洁色素，所以牙的表面就越来越黑；
2、龋齿：智齿刷牙不容易刷干净也容易龋齿，一旦智齿龋坏，龋齿周围的牙质都腐烂，自然就表现为黑色。食物残渣进到龋洞里也会腐烂，在细菌的作用下产酸腐蚀牙体，使得牙齿变色、洞越来越深，深到一定程度会有感觉，比如对冷、热、酸、甜敏感，如果不及时治疗，深到一定程度还会造成牙髓炎。
所以对于变黑的智齿一定要定期检查，如果发现龋齿能补尽量补，不能补可以把智齿拔掉。