咖啡中含有咖啡因等物质，能够刺激胃肠蠕动，便会出现放屁增多即排气增多现象。对于胃肠功能较好的患者，通常没有关系，但对于有胃肠疾病患者，喝咖啡后，便会对胃肠黏膜产生刺激性作用，同时可能会诱发慢性胃炎、胃溃疡、十二指肠溃疡症状加重，比如出现腹胀、腹痛、嗳气、反酸、肛门排气增多，甚至腹泻等临床表现。
因为会加重胃肠道疾患，所以不建议空腹喝咖啡。正常患者的胃黏膜，也可能会出现胃黏膜急性损伤。建议每天喝咖啡不超过250ml，也不建议喝过浓的咖啡。因为喝咖啡量较大、浓度较高，对胃黏膜有刺激作用，同时会使精神比较亢奋，休息较差，便会加重胃肠道 功能紊乱，所以要适量喝咖啡。