毛细支气管炎以咳喘症状为主，重症病例可以有乏氧的表现，需要给予氧气补充，进行吸氧治疗。并且根据病情的轻重、孩子的年龄，选择面罩吸氧或鼻导管吸氧，针对喘息发作，需要给予雾化吸入速效支气管扩张剂联合吸入糖皮质激素进行治疗。如果经过雾化治疗，仍然存在明显的喘息表现以及呼吸困难、乏氧症状，需要加用口服或静脉给予糖皮质激素治疗。
绝大多数的毛细支气管炎是由病毒感染引起，在治疗方面不需要应用抗生素，可以选择抗病毒的药物，但目前尚未有特殊、有效的抗病毒药物，可以试用干扰素雾化吸入，有一定的效果。对 于合并细菌感染、支原体感染的患儿，需要选择相应敏感的抗生素。如果喘息症状加重，会通过呼吸道丢失较多水分，可以给予静脉补液治疗，防止出现脱水症状。而如果患儿有胃肠道症状，也需要进行相应的对症治疗。