大部分情况下皮脂腺囊肿需进行开刀治疗，皮脂腺囊肿是常见疾病，由于毛囊阻塞，导致皮脂腺囊肿内有较多豆腐渣样感染物质，具有包膜，通过挤压或清创消毒方式，只能将其内的感染组织去除。如果不去除包膜，病情会反复发作。
在麻醉状态下可以将患者的皮脂腺囊肿完整切除，给予规律换药。少数患者的皮脂腺囊肿生长于脸部，局部出现红肿，可能不能进行手术，需进行规律换药，使用专用的挖勺去除感染组织，有时能将囊皮去除，容易去除不净，导致病情再次发作。患有皮脂腺囊肿后需尽早到医院，找专科医生进行处理，不能自行处理，防止病情加重。治疗期间患者应避免饮用含有酒精的饮品，不能吃过于辛辣的食物，避免病情进一步加重。