对于双肾积水，需要找医生诊断双肾积水的原因，采取不同的治疗方式。如果双肾积水由外科原因导致，可以通过外科手段治疗，大多数病人都可以治愈。如是先天性肾盂输尿管连接部狭窄，通过离断成型术，可缓解病人的狭窄因素，可以治好。有些病人有先天性马蹄肾，肾脏在发育过程中，两边肾脏连在一起没有分开。年轻的病人要将马蹄肾分开，把两边肾盂角度进行修正，让两边积水的肾脏得到缓解，也可以治愈。对于双肾积水的原因，比如病人有双侧输尿管梗阻、结石情况，通过外科手段把结石和梗阻的因素祛除后，双侧肾脏积水的情况也会得到缓解，病情会好转、治愈。
还有比较常见的原因如下尿路梗阻，如有些病人是神经源性膀胱，排尿功能出现障碍，或老年人患男性前列腺肥大、前列腺增生导致排尿困难，导致双侧输尿管扩张、双侧肾盂积水。将下尿路的梗阻因素解除，比如做前列腺电切手术，把梗阻的前列腺部位切掉，或做膀胱造瘘，使下尿路的尿流引流通畅以后，双肾积水的情况也会得到缓解。