阴茎起水泡原因是多方面，所以要针对具体情况进行分析：
1、外界摩擦：最常见的就是内裤摩擦。因为有些内裤的材质问题，和阴茎摩擦以后，有的男性就会出磨出水泡来；
2、过敏性病变：有些食物或者药物过敏以后，男性生殖系统会出现皮疹，有的皮疹厉害的时候，就会出现水泡，大多数情况下还会有发痒的感觉；
3、病毒感染：疱疹病毒如果感染了阴茎，会表现出有水泡，这些水泡一般集中在龟头，包皮上有时候也会出现，这时候患者会感觉到疼痛。
所以如果患者自身不能找到起水泡的原因，应该到医院做进一步检查，来明确病因，进行恰当的治疗。