甲状腺穿刺基本上可以诊断所有类型的甲状腺癌组织，包括乳头状癌、滤泡性癌、髓样癌、低分化或未分化和其他少量类型的癌。
甲状腺的穿刺检查，是诊断甲状腺疾病中最常见的一种诊疗手段，在甲状腺肿瘤诊断中非常有价值。但甲状腺穿刺在诊断甲状腺癌时存在一定困难，尤其在分型诊断时，主要通过细胞的异型性，如核大、浓软，或者细胞的排列，包括杂乱排列，以及有没有核内包含体等情况来诊断甲状腺癌。
在甲状腺癌里最常见的就是甲状腺乳头状癌，其他类型 的癌症加起来总数不超过10%，所以其实甲状腺穿刺主要诊断的是甲状腺乳头状癌。
在诊断甲状腺乳头状癌时的精准率，与取标本的量和组织有一定的关系，甲状腺穿刺很难达到100%的精确率，但如果穿刺成功，对于诊断甲状腺癌还是比较可靠的。