膀胱低级别乳头状尿路上皮癌不是原位癌。膀胱低级别乳头状尿路上皮癌通常通过外生性生长，膀胱镜检可发现，B超或CT影像检查可看到膀胱占位性病变，这类肿瘤通常考虑手术切除，再加术后灌注化疗，可达到临床治愈，而且5年治愈率非常高，超过95%。
原位癌通常局限在黏膜层，没有侵犯肌层，具有侵袭性特点，膀胱镜检下很难从肉眼上发现存在外生性占位性病变。一般通过脱落细胞学检查或者膀胱镜下随机活检，取得活检中发现原位癌病变。
膀胱原位癌分为原发性、继发性和伴发性，原发性通过尿液和随机活检发现，而继发性部分是术后灌注化疗，或者后期在检查的尿液中或者后期活检中发现。
伴发性是有时膀胱肿瘤行根治性切除后，在肿瘤以外的区域发现癌细胞，即原位癌细胞，与膀胱低级别乳头状尿路上皮癌的区别很大，恶性度和侵袭性也有一定的区别。