精子有可能被堵住，但一般不会被结石堵住。精子最常见被堵住的部位包括附睾，由于附睾炎症带来的附睾管的梗阻，输精管由于输精管的损伤比如结扎或者疝气损伤带来的输精管梗阻，精囊或者射精管一般由于精囊囊肿或者局部的炎症，另外还可能在睾丸内梗阻，这种情况相对比较少见且病因不明。
理论上以上几种途径都和结石没有必然关系，精子排出途径中只有一个地方有可能会长结石，那就是精囊中。如果精囊液排出不畅，加上局部有炎症，确实可能会带来精囊结石。
精囊结石主要表现往往是血精，也就是精囊结石刺激精囊壁，带来一定的炎症损伤而导致的血精，但是精囊结石本身一般不会大到能够把精子堵住的地步。
前列腺结石不存在把精子堵住的可能性，前列腺结石很多时候是前列腺的钙化而已，并不处在精子排出的途径上。
所以临床工作中确实能够看到梗阻性无精子症，就是精子排出的途径被堵住了。虽然可能存在堵塞，但是一般和结石没有必然关系。