牙周炎不能自愈。牙周炎是由于细菌形成菌斑，而菌斑钙化后形成牙石，会刺激牙龈及牙周组织而引起组织发炎。所以若想治愈牙周炎，需去除牙周炎的致病因子即牙石。通过对牙周炎系统性治疗，如龈上洁治术、龈下刮治术去除龈上牙石和龈下牙石，使牙龈炎症和牙周炎得到缓解，控制病情进一步发展，使牙周炎由活动期转变成静止期。
此外，中重度牙周炎不仅要进行龈上洁治和龈下刮治，同时还需进行牙周手术治疗，如翻瓣术、植骨术、牙周组织再生术，使牙周袋深度降低、牙槽骨吸收进一步停止。做完上述治疗以后，还需进行系统性维护治疗，如坚持正确刷牙、定时到医院进行检查，如果有牙石需再进行洁治术，通常0.5-1年进行一次龈上洁治。