输卵管癌和卵巢癌何者更严重的说法并不科学，因为卵巢癌临床分为三大类，包括腹膜癌、卵巢癌和输卵管癌，这三大生殖细胞肿瘤恶性程度基本类似，起源类似，临床很难判断何种来源。有一种学说认为卵巢癌是来源于输卵管的癌，腹膜癌同样如此，恶性程度和临床表现基本相似，因此临床处理也基本相同。
晚期输卵管癌和卵巢癌基本不能分辨，因为解剖上输卵管和卵巢附在一起，如果形成输卵管肿块和卵巢肿块，可能紧紧相连，因此在临床上经常把输卵管癌当作卵巢癌处理，卵巢癌当作输卵管癌处理。因此，输卵管癌恶性程度 高还是卵巢癌恶性程度高，没有确切定论。卵巢癌恶性程度主要依据肿瘤分化、肿瘤临床分期以及病理类型确定，不能一概而论。