HPV病毒与咽喉癌关系密切，但不能说HPV病毒能引起咽喉癌。HPV病毒也称为人乳头状瘤病毒，其实在社会上非常常见，分类大概有100多种，总体可归为两大类，即低危型和高危型，一般肿瘤患者身上会检测出高危型HPV病毒。目前国际公认，妇科宫颈癌和HPV有关，且是唯一关系明确的恶性肿瘤。
在头颈部肿瘤，如喉癌、下咽癌、口咽癌中，HPV扮演着非常重要的角色，且HPV阳性和HPV阴性在口咽癌部分患者中治疗方案完全不同，但在其它咽喉肿瘤里只能称关系非常密切。我国并未将HPV病毒提出作为独立致病因素，从而进行相应干预，所以目前引起咽喉癌的常见因素还是吸烟、饮酒、空气污染以 及其他有害、刺激性物质，并不包括HPV感染。