卵巢囊肿一般是通过妇科检查及B超来发现，有些病人甚至自己能够摸到腹部包块，女性朋友来医院做检查时，建议在月经干净的七天之内检查，因为卵巢随着月经周期有周期性变化，可能存在黄体囊肿等，所以月经以后会缩小或消失。如果为卵巢肿瘤，一般没有特殊症状，增大后会有压迫症状或疼痛、感染甚至蒂扭转或恶变，产生一定症状。所以患有卵巢肿瘤的病人，建议到正规医院的专科做检查。
彩超是卵巢肿瘤的首选方法，还可以通过CT扫描、磁共振甚至PET-CT等来检查，主要确定卵巢肿瘤的内部结构以及外部关系，跟其它器官的关系往往也是鉴别良性跟恶性或卵巢肿瘤类型的一种方法。此外，还可以抽血查肿瘤标志物，如果肿瘤标志物CA125、CA199等较高，要考虑卵巢肿瘤有恶性的可能。此检查对恶性肿瘤组织类型的辨别有一定作用，也为今后的治疗做了比较好的参考。