细菌性脑炎和病毒性脑炎区别包括以下几点：
1、两者病原体不同：一个是细菌，一个是病毒。细菌和病毒生物习性不同，导致细菌性脑炎和病毒性脑炎好发年龄不同，好发时间不同，细菌性脑炎多见于小婴儿，因为血脑屏障发育不完全，一年四季都可以发生。病毒性脑炎小婴儿相对反而少见，存在季节流行性，细菌感染容易出现脑膜炎，脑膜炎加重才会出现脑膜脑炎，因此脑膜刺激征较明显才会出现脑炎症状，病毒感染容易出现脑炎，脑膜刺激征较少见；
2、用药不同：细菌性脑炎主要应用抗生素，病毒性脑炎部分可以用特效抗病毒药物，大部分都以对症治疗为主；
3、两者后遗症不同，细菌性脑炎较特异性后遗症包括梗阻性脑积水，硬膜下积液、积脓，脑脓肿等，病毒性脑炎后遗症中脑软化较多见。