因卵巢功能早衰发病机制尚不明确，目前尚无有效方法恢复卵巢功能。治疗主要是通过激素补充，缓解低雌激素的症状，预防心血管疾病和骨质疏松发生。对于是否有生育要求，治疗区别如下：
1、无生育要求：由于部分诊断为早发性卵巢功能减退的患者，仍有怀孕的机会，所以需要做避孕措施。可以考虑人工周期辅助宫内节育器等避孕措施，或口服短效避孕药；
2、有生育需求：应使用天然雌激素和孕激素补充治疗。对于卵巢功能减退者，应积极辅助生殖技术助孕。对于不愿使用激素或者有激素禁忌症的患者，则可以选择植物类药物、中医药等进行治疗。