肾结核多数由血源性感染引起，原发病灶主要位于肺部，结核杆菌随血流侵入肾脏引起感染，90%位于皮质，10%位于实质。如患者免疫力高、细菌少，则病变局限于皮质内，形成微小肉芽肿，结核感染多可治愈。
若患者免疫力低，病变继续侵犯，形成干酪样变和结核脓肿，脓肿可破入肾盏，坏死物排出形成空洞。CT表现因肾结核发展的不同阶段而表现各异，具体如下：
1、早期显示为肾实质内多发形态不规则低密度灶及空洞，边缘不规则，可与肾盂肾盏相通，增强扫描病灶内无明显强化；
2、病变进展期可表现为部分生长或全部生长，肾盂扩张呈多发囊性低密度灶；
3、病变可见大小不一的钙化灶，呈点状或者 不规则高密度影；
4、晚期肾脏体积缩小，皮质部分形态不规则，肾盂、肾盏明显增厚，肾大部分或全部弥漫性钙化。输尿管常完全闭塞，但膀胱结核可逐渐好转，形成肾自截。