利用甲硝唑栓剂的时候，治疗的目的是为了治疗细菌性阴道病，并没有办法去治疗霉菌性阴道炎(外阴阴道假丝酵母菌病)，但是也并不会导致女性原有的外阴阴道假丝酵母菌病进一步加重。
实际上女性在阴道内本身就是有着很多种细菌在相互依赖、相互平衡、相互制约、共同生存，在这里本身就有厌氧菌，也有假丝酵母菌，也就是霉菌的存在。只不过当阴道内的菌群平衡被破坏的时候，就容易导致加德纳尔菌等厌氧菌的异常增殖，出现就是细菌性阴道病症状。
患者会出现阴道瘙痒，会出现白带的增多，而且白带会带有非常典型的腥臭味，所以此时需要应用甲硝唑栓来进行治疗。但 是还有一部分女性本身阴道内的菌群完全被破坏，可能不仅仅会有厌氧菌的存在，还会有更多假丝酵母菌存在，所以此时会需要同时联合用药。
可是如果单纯的只应用甲硝唑栓能够杀灭厌氧菌，可对于霉菌没有任何的治疗作用。所以在复杂性感染的状态下，就有可能会出现应用甲硝唑栓之后，外阴阴道假丝酵母菌病反而还会加重。
实际上并不是因为甲硝唑栓加重外阴阴道假丝酵母菌病，只不过因为甲硝唑栓对于霉菌没有任何的疗效，在治疗的时候外阴阴道假丝酵母菌病没有得到有效的遏制，所以才会在用药之后还会出现进一步加重的症状。这本身并非是甲硝唑栓剂的问题，而是在用药选择上出现的问题。