奥利司他胶囊的副作用，并不主要是对肝脏的影响，奥利司他胶囊是胰脂肪酶的抑制剂。通过减少食物当中的脂肪吸收，帮助把食物当中的脂肪从肠道当中排出，有轻度的减重作用。
奥利司他胶囊主要的副作用是胃肠道反应，可以出现大便带油、恶心、呕吐，上腹不舒服、甚至出现大便急、控制不住大便。由于奥利司他胶囊影响脂肪的吸收，副作用还有可能是影响脂溶性维生素的吸收。使用奥利司他胶囊有一定的减重疗效，是因为有多方面的临床证据证明，能帮助减少体重5%以上，一定是在健康的生活方式的基础上辅助减重。
由于奥利司他胶囊在进行临床研究的时候，并没有在有严重的肝脏、肾脏损害的人群中使用的证据。因此奥利司他胶囊虽然副作用不是伤肝和伤肾，但是有严重肾功能不全或肝功能损害的人，不应该使用奥利司他胶囊。