在同房时戴避孕套且避孕套也没有破，但是事后发现怀孕，原因在于没有做到科学、合理地应用：
1、射精时佩戴避孕套：避孕套在阴茎勃起时就应该戴上，而不是等到射精时再戴；
2、射精前佩戴避孕套：部分女性在同房过程中，男方勃起之后并没有戴避孕套，而进行性生活，在射精之前才去戴避孕套，这样精子会混入少量前列腺液，进入阴道深处进行受孕。因此，同房时即使佩戴避孕套，但是由于佩戴之前，已有精子进入女性生殖道受孕；
3、没有将阴茎和避孕套一同抽出：导致避孕套残留于阴道内部，在取套的过程中，精液逆流进入女性生殖道，也会引发怀孕。
如果佩戴避孕套的时机和摘套的时机没有掌握准确，也会引起怀孕，因此在应用避孕套时，应特别注意。