经常自慰不是导致不孕不育的主要原因，但如果没有注意工具清洁，可能导致感染而导致输卵管性不孕。无论在男性还是女性中均存在自慰，适度自慰对于放松心情，即避免紧张、焦虑情绪有一定作用。因此临床并不是反对自慰，但需注意自慰工具的清洁。
女性对于自慰工具一定要注意做好消毒工作，如果局部消毒不彻底，可能导致工具内微生物定植到阴道而导致宫腔或盆腔感染。此时可能导致输卵管感染，输卵管积水、阻塞，甚至可能导致输卵管性不孕。因此女性在自慰过程中一定要注意外阴和阴道的清洁，同时自慰也需要 适度，临床不建议和提倡过度自慰。