全身麻醉的后遗症，目前主要有一种叫术后认知功能障碍，全麻后病人认知功能会出现障碍，尤其是短期内。但术后认知功能障碍也不完全是全麻以后都会出现，研究资料显示有许多局部麻醉手术以后的病人也会出现术后认知功能障碍，这与不同的患者有直接关系。
有临床观察认为，绝大多数老年人，尤其是年龄比较大一点的老年人，全麻后出现认知功能障碍的比例比较高。但并非全麻后做手术均会出现认知功能障碍，其他原因也会出现，如创伤。
全身麻醉的时候，比如要做气管插管，插管过程中损伤牙齿，也算全麻的后遗症。气管插管的过程中出现声 门的影响，比如全麻后出现声音嘶哑，或杓状软骨的脱位，可能也算全麻的后遗症。