上颌窦囊肿严重与否，应根据患者临床症状以及CT检查结果综合判断。上颌窦囊肿合并感染，通常表现为鼻窦炎症状，如打喷嚏、流脓鼻涕、鼻塞，甚至出现头痛、嗅觉下降，此时应适当给予治疗，在药物治疗无效的情况下，可采取手术治疗的方法切除囊肿，并且治疗鼻窦炎。
部分上颌窦囊肿在CT检查时，尤其是鼻窦CT检查中无意发现，此时囊肿较小且没有伴发鼻窦炎症状，可根据情况随诊、观察，在患者出现症状后再给予治疗即可。而上颌窦囊肿属于良性病变，且没有恶变趋势，所以应根据患者情况、临床症状以及鼻窦CT检查结果综合判断囊肿是否需要治疗。