肾积水发生的原因主要在于泌尿系统的梗阻，所以在肾积水的治疗中，最重要的就是去除梗阻、通畅尿液，从而改善或者治愈积水，具体如下：
1、先天性肾盂输尿管连接处狭窄：具有异位血管的牵拉，一般通过肾盂成形的手术进行治疗；
2、输尿管疾病：如输尿管结核、结石、肿瘤等疾病引起的肾积水，通过针对不同的疾病，采取不同的治疗方式，改善肾积水。结石可以进行体外碎石或者手术碎石，肿瘤尤其是恶性肿瘤，需要行肾脏和输尿管全长切除；
3、下尿路梗阻：通常是以解决下尿路梗阻为主要的治疗手段，如果是前列腺增生引起的肾积水，需要行 经尿道前列腺增生电切，如果是尿道狭窄引起的肾积水，就要行尿道修复手术；
4、其他：对于存在感染等因素，不能够立即行病因治疗的肾积水，通常采用留置双J管或者肾穿刺造瘘，引流尿液，待感染控制后再行积水病因的治疗，如果积水非常严重，造成肾脏的不可逆损害，有时要行肾脏全切手术。