巩膜色素斑形成的主要原因是眼球的眼白上会形成这种色素斑块。这种斑块一般是透过眼睛里面的色素膜或者由于色素膜的色素随着血管或神经的移行，在角膜或巩膜的表面形成。
眼睛分为角膜和巩膜两个部分，从外表看角膜是黑颜色的，巩膜是瓷白色的。有时候在瓷白色的巩膜上可以看到很多色素斑块。这种色素斑块是正常的生理现象，因为眼球由三层组织组成。第一层是瓷白色的巩膜，第二层是含有大量色素的色素膜或脉络膜，最内层是视网膜。
由于在发育的过程中，有时候巩膜变薄，可以透见黑色的色素膜，这时就能看到色素斑块。另一种情况是色 素膜的色素会随着神经和血管从身体里爬行到巩膜的表面，形成色素斑块。这种情况是正常的生理过程，不会引起器质或功能方面的异常。