目前已进入微创时代，若患者经妇科检查明确为良性囊肿则需进行考虑腹腔镜手术，通常会在患者腹壁上切5mm左右小手术孔，而在脐部切1cm左右的大手术孔。医生通常会将切除后囊肿装入较大取物袋内经由脐处取出。但如果患者已明确诊断卵巢囊肿属于恶性，则开口可能相对较大，正常情况下切口需超过囊肿直径以将其完整取出，减少囊肿破裂后导致肿瘤种植和扩散。
因此，通常情况下卵巢囊肿手术创口并不会过大，对于直径在10cm左右的囊肿均可通过微创手术进行治疗。而患者在术前需进行相关检查以明确卵巢囊肿良、恶性，若囊肿较小且囊内为液体容物，或诊断为畸胎瘤且未出现腹水、囊肿壁较为光滑，此时通常考虑为良性囊肿，可参照上述手术进行操作。