尿道镜检查的危害主要有以下几点：
1、尿道狭窄时行尿道膀胱镜检查，在检查过程中可能造成尿道损伤及直肠损伤；
2、尿道急性炎症期，如急性膀胱炎、尿道炎、前列腺炎、附睾炎，检查时可导致感染加重；
3、膀胱容量小于50ml时检查可能导致膀胱破裂；
4、一周内重复膀胱镜检查可以因为膀胱黏膜的水肿没有消退，难以反映真实的情况，对肿瘤的诊断及输尿管插管不利；
5、全身出血性疾病未控制的患者检查后血尿会明显；
6、女性月经期行膀胱镜检查可能导致泌尿道感染。
尿道镜检查后比较常见的并发症有尿频、尿痛、血尿，检查后要嘱病人多饮水。如果出现尿频、尿急、尿痛、血尿，需要给予一定的抗生素治疗。