儿童个子矮小的原因非常多，主要有以下原因：
1、家族影响：是最常见的因素，即爸爸妈妈或者爷爷奶奶矮，儿童的身高生长可能不像其他同龄孩子长得快和高；
2、重大疾病影响：如出生时是早产儿、低体重儿，或者儿童在小时有过重大的疾病，如肿瘤、肾病，需要长期用药，孩子在生长过程中容易受药物或者疾病影响；
3、和生长相关的某些疾病影响：如生长激素缺乏、甲状腺功能低下，会出现和激素缺乏相关的个子矮小。但凡和生长相关的疾病，都会影响到生长。还有一类疾病，如性早熟，即儿童长的比其他同龄孩子快 ，实际上是儿童提前长了，这会影响到儿童的终身高或成年身高，青春期前的儿童要关注这一点。