四联疗法导致大便次数多和量多，是由于肠道菌群失调导致，四联疗法包括2种抗生素，常用阿莫西林、克拉霉素、甲硝唑、四环素、喹诺酮类抗生素，治疗疗程一般是10-14天，大剂量抗生素较长时间使用，不仅会杀死幽门螺杆菌，而且对肠道正常菌群也有干扰作用，所以会出现菌群失调，导致大便次数增多以及量多。
对于健康人群而言，停用药物后菌群失调能够缓解，对于老年人而言，有可能会导致抗生素相关性腹泻。一旦发现大便次数多的情况下，可以增加益生菌，同时服用地衣芽孢杆菌，需要注意的是在服用抗生素时同 时增加益生菌，2种药物服用时间应该间隔2个小时以上，以免抗生素将有益菌破坏。总之四联疗法导致大便次数多且量多，是因为菌群失调引起，如果一旦出现症状可以加用益生菌缓解症状。