医生在给病人做肠镜时，如果发现检查过程中有异常，除了正常肠黏膜外，还有发现肠黏膜上有息肉、充血水肿、糜烂、溃疡等。这种情况下肉眼很难明确判断疾病的性质，此时就要取活检，即肠镜下把异常地方取几块组织，送到病理科进行检查，明确诊断。
送到病理科去以后，取下的活检组织必须经过一定程序的处理，要浸在福尔马林里面，最后要适量包埋，要涂腊，要切片等，最后制作完成以后，切片放在显微镜下，然后病理科医生在显微镜下，从细胞学的水平上才能观察疾病的种类，来明确诊断。所以这个过程其实要花一定时间，一般从收到病理科，到病理科处理，病理科阅片以后，需要七个工作日左右。
所以做肠镜要一个礼拜以后，才能看到活检的病理报告，这个程序很难再将其减免。但是大多数情况下，患者等一个礼拜，即使有异常情况，也不会对患者的诊断资料耽搁太久，所以这个程序必不可少。