小三阳病毒量主要指HBV-DNA的量，通常HBV-DNA的量，各家检测机构不一致，部分检测机构HBV-DNA<1000cps/ml时，无法检测出来，结果属于正常。部分检测机构<500cps/ml、<200cps/ml结果均属于正常。相对高灵敏度的检测方法，HBV-DNA<20cps/ml时，检测不到，此时HBV-DNA<20cps/ml判定为正常。
小三阳患者如果处于治疗状态，抗病毒治疗过程中，应尽量应用灵敏度相对更高的检测方法，HBV-DNA检测数值越低越好，应尽量选择HBV-DNA<20cps/ml作为标准。如果检测标准为HBV-DNA<1000cps/ml，当检测结果为900cps/ml时，也属于阴性。但如果用灵敏 度相对高的检测方法，正常量<20cps/ml，则900cps/ml也是阳性，如此易使患者在HBV-DNA转阴后，停止抗病毒治疗，高灵敏度的检测会让抗病毒治疗时长相对延长，可能延缓病情进展。