儿童肠套叠分非手术疗法和手术疗法，以非手术疗法为主，发病后24小时内，及时诊断和治疗效果较好，大多数不再复发。在非手术疗法中有X线监视下空气灌肠、钡剂灌肠和B超监视下水压灌肠复位疗法，空气灌肠复位已被长期广泛应用，复位率可高达95%。
首先取气囊导尿管，石蜡油润滑后插入患儿直肠内，连接自动控制压力结肠灌注器，患儿取平卧位，家长固定患儿肩部和大腿根部，X线透视下经导尿管往直肠内注入气体，可以看见肠套叠肿块影逐渐向回盲部退缩，即小肠和大肠交界部位，直到肿块影完全消失，气体进入小肠提示肠套叠已复位成功。选择手术疗法包括以下情况：
1、经空气加压灌肠等非手术复位未成功患儿；
2、如果发病时间超过24-48小时，存在严重脱水、精神萎靡、高热或休克等症状，查体有高度腹胀，腹部明显压痛、肌紧张，怀疑腹膜炎、肠坏死患儿；
3、X线监视下空气灌肠提示为小肠套叠；
4、高度怀疑为继发性肠套叠患儿，部分患儿可在腹腔镜下行肠套叠复位术，手术创伤小、术后恢复快。