药物流产规定在妊娠49天内进行，主要针对月经周期规律，而且是月经周期是28-30天的人群。如果孕囊不是太大，这种情况下可以进行药物流产。对于月经周期不规律的人群而言，并不是在妊娠49天内进行药流。如果女性40天来一次月经，然后在停经49天时有可能还未查出宫内孕。所以对于月经周期不规律的人群，一般需要通过B超判断孕囊大小，并且判断是否处于药流要求的停经天数之内。
此外，药物流产有很多限制，如年龄超过40岁、有抽烟及喝酒史、有肝肾功能障碍、对药物流产的药物过敏、青光眼、哮喘等，都是药物流产的禁忌症。