一侧太阳穴疼常见疾病首先是偏头痛。偏头痛比较常见疼痛部位是在太阳穴，尤其是在一侧太阳穴，可能每次发作是同一侧，或此次发作在右侧，下一次可能在左侧，但是太阳穴比较常见。此种疾病一定是反复发作，不止发作一次。疼痛性质一般是跳着疼，感觉像自己脉搏在跳动，叫搏动性头痛，而且持续时间一般在4-72小时。部分病人可以伴有恶心、呕吐、畏光、畏声表现，可以采用止痛药物或者休息缓解治疗。
另外跟颞动脉炎有关的问题，此种病人疼痛部位在太阳穴，但是在太阳穴部位，除疼外可以看到表浅颞动脉鼓起来，而且能够摸到鼓出来的动脉，此时疼痛非常剧烈 ，属于免疫性疾病。除以上两种情况外，一侧太阳穴疼可能是因为眼部疾患而连带太阳穴疼痛，此时患者需要去眼科排查有没有眼部疾病。