门静脉血栓是肝硬化门静脉高压患者，比较常见的并发症，肝脏存在硬化，而导致门静脉内的血流，向肝脏组织内部流入受阻，从而导致血液在门静脉中，造成瘀滞的状态，并且会形成很多涡流，给血栓的形成提供了条件。
血栓形成以后，又会进一步加重门静脉的压力，会导致门静脉高压相关的并发症，出现的几率增加。门静脉一旦形成了血栓以后，不需要通过手术的办法取栓，形成血栓的条件无法改变，就算用手术取出血栓，将再次形成血栓，也就是无法通过手术彻底治愈血栓。
在治疗上目前以内科保守治疗为主，需要看门静脉的压力，是否能够得到一定程度的控制，可以口 服降低门静脉压力的β受体阻滞剂，还可以考虑行TIPSS，也就是经颈静脉肝内门体分流术，采用分流的办法，使门静脉的压力得以降低。
也可以口服抗凝药阻止血液的凝固，但是有一定的风险，有可能会加重出血的风险，因为肝硬化的患者，经常会有食道-胃底静脉曲张，或者门脉高压性胃病，消化性溃疡的发病风险也较一般人高，本身就存在着出血的风险。
如果吃了抗凝药，会进一步加重出血的风险，因此在治疗上要权衡利弊。