肾结石是相对比较简单的疾病，但个别情况较复杂，从根治角度讲肾结石肯定能根治。现在治疗肾结石的方法非常多，比如用软镜进到肾盂、肾盏使结石破碎，用激光破碎或者震动碎石，还有一种方法是体外超声波碎石，如果太复杂的结石也可以经皮肾镜取石，以上方法都不行，还可以做开放性手术，如肾盂切开取石。
肾结石从原则上是可以根治的，但是个别情况下，比如结石非常复杂，将绝大多数结石都取出之后，还剩下零散小的结石，通常在不影响肾脏功能，以及今后患者的排尿的情况下，可以不进行治疗，因为如果再进行治疗成本很高，其中涉及到经济成本，也涉及到对肾脏损伤的成本。 如果单纯盲目的以清除结石为目的而去做结石，可能会增加肾脏损伤，造成不必要的损失，就会得不偿失，所以有时可放弃很小的结石，使其自然排出，总之肾脏结石可以根治。