大部分患者在移植后会出现腹部隐痛症状，属于正常情况。实际胚胎移植、种植属于侵袭性行为，胚胎本身需要侵袭性突破子宫内膜，并牢固种植在子宫内膜，此过程可能对子宫内膜存在一定影响，机体会出现一定反应，可能导致盆腔充血或子宫轻微收缩，属于胚胎着床过程中产生的反应。患者会出现月经感、小腹坠胀感，较敏感者可能出现小腹隐痛。
部分患者在胚胎种植过程中出现宫缩强烈时，可能出现下腹剧痛，部分患者可能出现睡眠时突然疼醒、大汗淋漓等症状。此种情况需要格外关注，需要到医院服用抑制宫缩的药物，但胚胎移植后是否出现反应无法进行判断。如果患者出现剧烈宫缩时，可能对胚胎种植存在一定影响，如果此次胚胎移植没有成功妊娠，在下一次移植当天开始，除常规保胎、孕激素保胎治疗外，还需要使用其他抑制 宫缩的药物治疗。